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Ejemplo de edición de ácidos nucléicos como tratamiento en cáncer de próstata

domingo, agosto 14, 2022

 



Ttitulo: Las pantallas CRISPR de todo el genoma revelan la letalidad sintética de la deficiencia de RNASEH2 y la inhibición de ATR

  • Para identificar los genes cuya pérdida hace que las células tumorales sean hipersensibles a la inhibición de ATR, realizaron cribados de genoma completo basados ​​en CRISPR/Cas9 en 3 líneas celulares independientes tratadas con un inhibidor de ATR altamente selectivo, AZD6738A partir de los genes candidatos, demostraron que la deficiencia de RNASEH2 es letal sintética con la inhibición de ATR tanto in vitro como in vivo.  En particular, la deficiencia de RNASEH2 se encuentra con frecuencia en el adenocarcinoma de próstata
Tipo de administración: Ex-vivo e invivo
Tipo de célula: celulas somáticas: 293A, HCT116, MCF10A  
Dirigido hacia:  ADN genomico : genes ATR 
Dirigido por: 
CRISPR/Cas9:pantalla Knockear , biblioteca y numero de genes ( TKOv3 (18,053))
Órgano a tratar: cáncer de Próstata
Via de administración: Parenteral- intralesional
Resultados  a corto plazo:  Las células deficientes en RNASEH2 mostraron niveles elevados de daño en el ADN y, cuando se trataron con AZD6738, sufrieron apoptosis 
Resultados a largo plazo: Las células deficientes en RNASEH2 mostraron niveles elevados de daño en el ADN y, cuando se trataron con AZD6738 sufrieron senescencia

Referencia:

1.-Wang C, Wang G, Feng X, Shepherd P, Zhang J, Tang M, et al. Genome-wide CRISPR screens reveal synthetic lethality of RNASEH2 deficiency and ATR inhibition. Oncogene [Internet]. 2019;38(14):2451–63. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1038/s41388-018-0606-4




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Inhibicación de la via canónica y no canónica WNT en celulas madre malignas de cáncer de próstata como un posible tratamiento

domingo, agosto 07, 2022


Tipo de celulas madre: celulas madre malignas mesenquimales

método de obteción/eliminación: Monoterapia anti-CSC dirigida a cascadas de señalización WNT

  • la señalización WNT canónica a través de los receptores Frizzled  y LRP5/6  es traducida por las cascadas de señalización WNT/ B-catenina  y WNT/STOP
  • la señalización WNT no canónica a través de FZD y/o ROR1/ROR2/RYK Los receptores son transducidos por las cascadas de señalización WNT/PCP (polaridad de células planas), WNT/RTK (receptor de tirosina quinasa) y WNT/Ca2+.

  • FÁRMACOS UTILIZADOS:
  • fármacos dirigidos a ligandos/receptores
  • tankirasa (TNKS) inhibidores que reprimen WNT/β-catenina
  • inhibidores de puercoespín (PORCN)
  • inhibidores de β-catenina

via de administración: via parenteral

Resultados a corto plazo: las células madre cancerosas representen sólo una pequeña proporción del tumor completo, destruirlas puede tener poco impacto a corto plazo en el tamaño del tumor completo.

Resultados a largo  plazo: a largo plazo se puede esperar que el tumor se agote y marchite porque ha perdido la capacidad de auto-renovarse. En este sentido, puede ser crítico combinar la terapia dirigida hacia las células madre cancerosas con agentes convencionales que destruyan el tumor.

Bibliografía:

  1. Katoh M. Canonical and non-canonical WNT signaling in cancer stem cells and their niches: Cellular heterogeneity, omics reprogramming, targeted therapy and tumor plasticity (Review). Int J Oncol [Internet]. 2017;51(5):1357–69. Disponible en: http://dx.doi.org/10.3892/ijo.2017.4129 referencia principal
  2. Angosto MC. CÉLULAS MADRE Y CÁNCER [Internet]. Radoctores.es. [citado el 8 de agosto de 2022]. Disponible en: https://www.radoctores.es/doc/1V13N1-cascales-celulasmadrecancer.pdf  referencia guía





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Modelo de adenocarcinoma de próstata de ratón transgénico (TRAMP): una buena alternativa para estudiar la progresión del cáncer de próstata

domingo, julio 31, 2022




El término TRAMP (Transgenic adenocarcinoma of the Mouse Prostate) ha estado presente en una amplia variedad de estudios para designar a un raton especifico modificado geneticamente.Este modelo se asemeja a las características del cáncer de próstata, se diseñaron ratones TRAMP Knockout utilizando el promotor mínimo de probasina de rata (−426/+28) para apuntar a la expresión grande del virus T SV40 y las oncoproteínas pequeñas t, solo en el epitelio prostático, inactivando la actividad supresora de tumores p53 y Rb en ​​la próstata. Como resultado, este modelo es capaz de desarrollar no solo CaP progresivo, sino también independencia androgénica y diseminación metastásica (1).


Objetivo del uso de este ratón:
  • monitorear la progresión de la lesión prostática en poco tiempo
  •  caracterización morfológica del tejido prostático y otros órganos
  •  metabolismo del cáncer
  •  diagnóstico; prevención; tratamiento
  •  descubrimiento de nuevos fármacos



Ventajas de los animales transgénicos
  1.  los animales transgénicos pueden superar enfermedades infecciosas
  2. Producción de fármacos
  3. Avances en estudios de enfermedades animales y humanas, como el cáncer
  4. Creación de bancos genéticos para evitar la extinción de las especies
  5. reducir la pérdida de animales
Desventajas de los animales transgénicos
  1. Al modificar especies ya existentes podemos poner en riesgo especies autóctonas
  2. Se usan animales vivos, por lo que es primordial hacer un examen ético y determinar cómo de novedoso e importante pueden ser los resultados del experimento
  3. La expresión de nuevas proteínas donde antes no existían puede provocar la aparición de alergias.
  4. Sufrimiento de los animales durante la experimentación
  5. pérdida del patrimonio genético que garantiza la biodiversidad
Ventajas de los vegetales transgenicos
  1. Disminución de las pérdidas de cultivo por plagas, y una disminución en el uso de plaguicidas
  2. Crecimiento acelerado del producto Aumento de la producción
  3. Se pueden modificar para mejorar la salud aumentado sus nutrientes
  4. Preservación de la biodiversidad
  5. Podrian solucionar el hambre mundial
Desventajas de los vegetales transgenicos
  1.  Complicaciones para regular y legalizar su uso
  2. Potenciales efectos negativos en la salud humana
  3. desarrollo de alergias, intolerancias y enfermedades autoinmunes
  4. Efectos negativos en la fauna silvestre
  5. Competición biológica


Referencias Bibliograficas:

  1. Kido LA, de Almeida Lamas C, Maróstica MR Jr, Cagnon VHA. Transgenic Adenocarcinoma of the Mouse Prostate (TRAMP) model: A good alternative to study PCa progression and chemoprevention approaches. Life Sci [Internet]. 2019;217:141–7. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/j.lfs.2018.12.002
  2. Maqueda AD. Animales transgénicos - Definición, ejemplos y características [Internet]. expertoanimal.com. 2018 [citado el 31 de julio de 2022]. Disponible en: https://www.expertoanimal.com/animales-transgenicos-definicion-ejemplos-y-caracteristicas-23679.html
  3. Fernandes AZ. Ventajas y desventajas de los alimentos transgénicos [Internet]. Diferenciador. 2021 [citado el 31 de julio de 2022]. Disponible en: https://www.diferenciador.com/ventajas-y-desventajas-de-los-alimentos-transgenicos/

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ADN recombinante en la naturaleza y artificial

sábado, julio 23, 2022


Un ejemplo de ADN recombinante natural son las bacterias las cuales realizan su transferencia genetica mediante tres tipos de mecanismos. La transformación, la conjugación y la transducción  (1). 

Por otro lado  se ha venido utilizando como terapia para el cáncer de próstata las vacunas  de Alfavirus (virus de ARN monocatenario),los cuales son vectores virales capaces de integrarse en las células humanas y expresar sus genes de un modo eficaz,lo que se hace es  eliminar las regiones del genoma viral necesarias para su replicación y patogénesis y reemplazadas por aquellos genes terapéuticos que deseemos transferir (2).

Titulo:Alphaviruses in Cancer Therapy

Objetivo:prevención y terapeútico

Genes:genes de la proteína no estructural (nsP), el promotor subgenómico 26S, el gen de interés (GoI) y la señal poli A.

Enzimas de restricción: no describe

Enzima Ligasa: Ligasa

Vector del virus:  virus de la encefalitis equina venezolana (EEV)

El vector auxiliar contiene el promotor subgenómico, los genes de la proteína estructural (C-p62-6K-E1) y la señal poli A

Celula receptora:células de mamífero tales como células BHK-21

 -La polimerasa de ARN SP6 se ​​usa para in vitrotranscripción del genoma de ARN de alfavirus de longitud completa,

Método de inserción del gen:  transfección- mediante electroporación 

Método de identificacíón de clones:

 inoculación en animales

Las partículas de VEE que expresan el antígeno de membrana específico de la próstata (PSMA) indujeron respuestas inmunitarias específicas de PSMA sólidas en ratones BALB/c y C57BL/6

-las respuestas inmunitarias se caracterizaron por citoquinas Th-1, potente actividad CTL y anticuerpos IgG2a/IgG2b ,por lo que se utilizo pruebas de serologia.




Referencias Bibliograficas:

  1. Kivisaar M. Mutation and recombination rates vary across bacterial chromosome. Microorganisms [Internet]. 2019;8(1):25. Disponible en: http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms8010025
  2. Lundstrom K. Alphaviruses in cancer therapy. Front Mol Biosci [Internet]. 2022;9:864781. Disponible en: http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2022.864781


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Técnica de hibridación FISH para la detección de neoplasias Hematológicas

domingo, julio 17, 2022



Para las Neoplasias mieloides se recomienda el uso de FISH, una técnia que utiliza sondas de ADN especificas y detecta fusiones de genes recurrentes que involucran PDGFRA, PDGFRB, FGFR1, PCM1-JAK2.

Primero se toma la muestra de sangre periférica,después se realiza un cultivo de 1-2  días con forbol 12-miristato 13-acetato y se añade colchicina al cultivo para impedir la formación del uso mitótico.Finalmente se añade solucion salina para lisis celular, se realiza la técnica FISH en donde se pintaran los cromosomas con fluorocromo,esta técnica analiza el genoma completo y  permite la identificación de la evolución clonal y la presencia de múltiples clones independientes.



Bibliografía: 

  1. Rack KA, van den Berg E, Haferlach C, Beverloo HB, Costa D, Espinet B, et al. European recommendations and quality assurance for cytogenomic analysis of haematological neoplasms. Leukemia [Internet]. 2019 [citado el 18 de julio de 2022];33(8):1851–67. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30696948/


Técnica de hibridación FISH para la detección de neoplasias Hematológicas Técnica de hibridación FISH para la detección de neoplasias Hematológicas Reviewed by Salome_Quila on domingo, julio 17, 2022 Rating: 5

PCR digital como herramienta para medir la persistencia del VIH

domingo, julio 10, 2022

Para encontrar una cura que pueda erradicar el reservorio latente del VIH , se debe poder cuantificar el virus persistente,actuamente se esta utilizando la PCR digital ya que es la unica que permite la cuantificación de objetivos absolutos. la plataforma de PCR digital  QX200 ddPCR de Bio-Rad es la más utilizada en la investigación del VIH,aqui se utiliza  la química de emulsión de agua en aceite para crear particiones que seran amplificadas. La fase acuosa que consta de cebadores, sonda Taqman y supermezcla, muestra y aceite mineral se carga en un soporte diseñado específicamente,estos datos se analizan utilizando estadísticas de Poisson para determinar la concentración de la plantilla de ADN

Titulo:PCR digital como herramienta para medir la persistencia del VIH

Objetivo:Diagnóstico y tratamiento

Tipo de muestra :sangre (suero sanguíneo)

Extracción del AN: se utilizo la plataforma digital QX200 ddPCR de Bio-Rad

Tipo  de ácido nucléico:ARN retroviral

Genes amplificados :gen GAG,gen POL,gen ENV

Tipo de PCR: PCR digital de cuantificación absoluta , la cual consta de  cuatro  pasos :preparación de la  muestra,división o distribución,PCR, analisis de resultados.



Bibliografía:

  1. Rutsaert S, Bosman K, Trypsteen W, Nijhuis M, Vandekerckhove L. Digital PCR as a tool to measure HIV persistence. Retrovirology [Internet]. 2018 [citado el 11 de julio de 2022];15(1). Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29378600/
  2. Droplet Digital PCR (ddPCR) technology [Internet]. Bio-Rad Laboratories. [citado el 11 de julio de 2022]. Disponible en: https://www.bio-rad.com/es-ec/life-science/learning-center/introduction-to-digital-pcr/what-is-droplet-digital-pcr?ID=MDV31M4VY

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Alteraciones epigenéticas por Aflotoxina-b1 en la inducción de hepatocarcinomas

lunes, junio 27, 2022





Las aflotoxinas son un tipo de micotoxinas producidas por cepas toxigénicas de hongos, principalmente Aspergillus flavus y Aspergillus parasiticus,estas se encuentan en alimentos como maíz, arroz, maní y otros, que han tenido un mal manejo postcosecha. La aflatoxina B1 (AFB1) es el factor con mayor capacidad de provocar o acelerar el cáncer,  Las modificaciones genéticas comienzan en el hígado a través del AFB1 biomórfico, el activo AFB1-exo-8.9-Epoxy, que interactúa con el ADN para formar aductos de AFB1-DNA. Estos aductos inducen una mutación en el codón 249, mediada por una transversión de G-T en el gen supresor de tumores p53 , que causa carcinoma hepatocelular.

Bibliografía:

  1. Ferreira RG, Cardoso MV, de Souza Furtado KM, Espíndola KMM, Amorim RP, Monteiro MC. Epigenetic alterations caused by aflatoxin b1: a public health risk in the induction of hepatocellular carcinoma. Transl Res [Internet]. 2019 [citado el 28 de junio de 2022];204:51–71. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30304666/
  2. Marchese S, Polo A, Ariano A, Velotto S, Costantini S, Severino L. Aflatoxin B1 and M1: Biological properties and their involvement in cancer development. Toxins (Basel) [Internet]. 2018 [citado el 28 de junio de 2022];10(6):214. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29794965/



Alteraciones epigenéticas por Aflotoxina-b1 en la inducción de hepatocarcinomas Alteraciones epigenéticas por Aflotoxina-b1 en la inducción de hepatocarcinomas Reviewed by Salome_Quila on lunes, junio 27, 2022 Rating: 5
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